网站结构最为清晰的两种表现形式就是导航与网站地图。

创建网站导航时，需要考虑用户及搜索引擎蜘蛛的需求。正如上文提到，扁平的网站结构有益于用户与蜘蛛更快捷地找到目标内容。一个清晰易用的导航是任何网站的重要组成部分。创建导航不应操之过急，需要仔细思考网站的内容、主题、分类，并用卡片测试不同导航流量，而不是创建后就直接开始使用。

具体来说，对导航的优化可以分为一下6步：

首先，列出网站中必需的内容页面，如博客、文章、产品介绍等等。其次，创建一个能够容纳其下各项具体内容的一级导航菜单。然后，与传统的从上到下的工作方式相反，从细节内容开始，从下至上的进行有组织的结构构建。完成下层内容构建后，补充中间部分的内容。为顶层页面与低端内容之间构建次级导航结构。在较小的网站中这一层级可能并非必须，而在较大的网站中两三层次级导航可能都是必要的。随后可以加上二级页面，诸如版权申明、联系方式和其他重要性较弱的信息。最后，构建分级图示，从上到下至少展示到次级导航的最后一层。

许多网站有HTML格式的网站地图，但大多数现在使用的都是XML格式的。XML格式的网站地图提供了网站上的URL列表，将XML提交给主要搜索引擎，意味着所提交的URL页面是希望被抓取的。当然，将URL列在XML网站地图上并不能保证页面被收录，但确实能使搜索引擎更快地找到该页面，提高收录的可能性。

最好的是既有HTML也有XML格式的网站地图。XML网站地图为搜索引擎服务，而HTML则为用户服务。谷歌前搜索部门反垃圾组负责人、资深SEO工程师Matt Cutts曾说过，“一旦有了HTML网站地图，制成XML地图就轻而易举，所以我的建议是，可以的话就两个都做吧”。创建网站地图并不复杂，尤其在网站结构构建好后。创建HTML格式的地图，需要在网站上创建一个新的HTML页面，其中包含所有URL的分级列表。这就体现了网站的导航。对于创建XML网站地图，有很多创建工具可以使用。在使用中需要注意的是，不一定所有内容都需要出现在网站地图上，比如说，登录页面、分页和其他价值不高的页面都是可以在地图上省去的。

总而言之，SEO优化不仅限于内容和链接，有许多可变因素都会影响网站可见度。长期来看，构建稳固合理的网站结构是非常有益的。了解网站对应用户，并依据其特点改善网站结构，提升其使用、查找时的简便度。在这个过程中，网站结构也会对蜘蛛更为简便易读。由此，网站内容将更容易被用户和蜘蛛获取和理解，网站可见度从而得以提升。